Управление Центром осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности

Единоличным исполнительным органом Учреждения является директор: Козина Елена Николаевна

Коллегиальные органы управления Центром: 

• Общее собрание трудового коллектива  (Положение)
• Педагогический совет (Положение)

Деятельность

•  Учебно-методический отдел (Положение). Направление деятельности. Исакова Светлана Петровна, руководитель учебно-методического отдела.
•  Отдел мониторинга, образовательной статистики, аналитики (Положение). Направление деятельности. Инфотека Центра (Положение). Икартс Наталия Александровна, руководитель отдела мониторинга,образовательной статистики, аналитики и инфотеки 

Структурных подразделений нет.